Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smg9Q9DB90 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smg9Q9DB90 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smg9Q9DB90 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smg9Q9DB90 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smg9Q9DB90 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Smg9Q9DB90 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smg9Q9DB90 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms