Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAF1

1700012A03Rik, RIKEN cDNA 1700012A03 gene, mousemouse

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Length 130 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700012A03RikQ9DAF1 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
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1700012A03RikQ9DAF1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700012A03RikQ9DAF1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
1700012A03RikQ9DAF1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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1700012A03RikQ9DAF1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
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1700012A03RikQ9DAF1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700012A03RikQ9DAF1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
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1700012A03RikQ9DAF1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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1700012A03RikQ9DAF1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700012A03RikQ9DAF1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
1700012A03RikQ9DAF1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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1700012A03RikQ9DAF1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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1700012A03RikQ9DAF1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
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1700012A03RikQ9DAF1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
1700012A03RikQ9DAF1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
1700012A03RikQ9DAF1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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1700012A03RikQ9DAF1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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1700012A03RikQ9DAF1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
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1700012A03RikQ9DAF1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
1700012A03RikQ9DAF1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12 ms