Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9V4

Rsph9, Radial spoke head protein 9 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph9Q9D9V4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph9Q9D9V4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph9Q9D9V4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph9Q9D9V4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Rsph9Q9D9V4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Rsph9Q9D9V4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph9Q9D9V4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph9Q9D9V4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rsph9Q9D9V4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rsph9Q9D9V4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rsph9Q9D9V4 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rsph9Q9D9V4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms