Protein–RNA interactions for Protein: Q9D968

Hcfc2, Host cell factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcfc2Q9D968 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Hcfc2Q9D968 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Hcfc2Q9D968 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcfc2Q9D968 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Hcfc2Q9D968 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms