Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Atg7Q9D906 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Atg7Q9D906 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Atg7Q9D906 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Atg7Q9D906 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Atg7Q9D906 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg7Q9D906 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg7Q9D906 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg7Q9D906 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms