Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd12Q9D8W5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd12Q9D8W5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Psmd12Q9D8W5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Psmd12Q9D8W5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd12Q9D8W5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd12Q9D8W5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd12Q9D8W5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms