Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8V0

Hm13, Minor histocompatibility antigen H13, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hm13Q9D8V0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Hm13Q9D8V0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hm13Q9D8V0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hm13Q9D8V0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Hm13Q9D8V0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Hm13Q9D8V0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hm13Q9D8V0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Hm13Q9D8V0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Hm13Q9D8V0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hm13Q9D8V0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hm13Q9D8V0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hm13Q9D8V0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hm13Q9D8V0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hm13Q9D8V0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hm13Q9D8V0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms