Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Derl3Q9D8K3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Derl3Q9D8K3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Derl3Q9D8K3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Derl3Q9D8K3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Derl3Q9D8K3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Derl3Q9D8K3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms