Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7N3

Mrps9, 28S ribosomal protein S9, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps9Q9D7N3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Mrps9Q9D7N3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Mrps9Q9D7N3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Mrps9Q9D7N3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Mrps9Q9D7N3 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Mrps9Q9D7N3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrps9Q9D7N3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrps9Q9D7N3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrps9Q9D7N3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Mrps9Q9D7N3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrps9Q9D7N3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrps9Q9D7N3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Mrps9Q9D7N3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms