Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Echdc3Q9D7J9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Echdc3Q9D7J9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Echdc3Q9D7J9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Echdc3Q9D7J9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Echdc3Q9D7J9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms