Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Capns2Q9D7J7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Capns2Q9D7J7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Capns2Q9D7J7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Capns2Q9D7J7 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Capns2Q9D7J7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Capns2Q9D7J7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Capns2Q9D7J7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Capns2Q9D7J7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 173.8 ms