Protein–RNA interactions for Protein: Q9D572

Ubxn11, UBX domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn11Q9D572 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Ubxn11Q9D572 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ubxn11Q9D572 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Ubxn11Q9D572 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ubxn11Q9D572 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ubxn11Q9D572 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ubxn11Q9D572 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ubxn11Q9D572 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ubxn11Q9D572 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ubxn11Q9D572 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms