Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4X6

Samt4, Spermatogenesis-associated multipass transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samt4Q9D4X6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samt4Q9D4X6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Samt4Q9D4X6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samt4Q9D4X6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Samt4Q9D4X6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Samt4Q9D4X6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Samt4Q9D4X6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Samt4Q9D4X6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Samt4Q9D4X6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Samt4Q9D4X6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms