Protein–RNA interactions for Protein: Q9D312

Krt20, Keratin, type I cytoskeletal 20, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt20Q9D312 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krt20Q9D312 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Krt20Q9D312 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krt20Q9D312 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Krt20Q9D312 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Krt20Q9D312 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Krt20Q9D312 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms