Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
1700034E13RikQ9D2T6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
1700034E13RikQ9D2T6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
1700034E13RikQ9D2T6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
1700034E13RikQ9D2T6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
1700034E13RikQ9D2T6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
1700034E13RikQ9D2T6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms