Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1Q4

Dpm3, Dolichol-phosphate mannosyltransferase subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpm3Q9D1Q4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Dpm3Q9D1Q4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Dpm3Q9D1Q4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Dpm3Q9D1Q4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Dpm3Q9D1Q4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dpm3Q9D1Q4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms