Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1D1

Tspan11, Tetraspanin-11, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan11Q9D1D1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan11Q9D1D1 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tspan11Q9D1D1 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan11Q9D1D1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan11Q9D1D1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tspan11Q9D1D1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tspan11Q9D1D1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tspan11Q9D1D1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
Tspan11Q9D1D1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tspan11Q9D1D1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tspan11Q9D1D1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tspan11Q9D1D1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms