Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C2

Cby1, Protein chibby homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cby1Q9D1C2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Cby1Q9D1C2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cby1Q9D1C2 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Cby1Q9D1C2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Cby1Q9D1C2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cby1Q9D1C2 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Cby1Q9D1C2 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms