Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0B6

Pbdc1, Protein PBDC1, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pbdc1Q9D0B6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Pbdc1Q9D0B6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Pbdc1Q9D0B6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pbdc1Q9D0B6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pbdc1Q9D0B6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Pbdc1Q9D0B6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Pbdc1Q9D0B6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.9 ms