Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Rpusd4Q9CWX4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rpusd4Q9CWX4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rpusd4Q9CWX4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Rpusd4Q9CWX4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Rpusd4Q9CWX4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Rpusd4Q9CWX4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms