Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tdrd12Q9CWU0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tdrd12Q9CWU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Tdrd12Q9CWU0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Tdrd12Q9CWU0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Tdrd12Q9CWU0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Tdrd12Q9CWU0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Tdrd12Q9CWU0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms