Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR59

Gadd45gip1, Growth arrest and DNA damage-inducible proteins-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gadd45gip1Q9CR59 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Gadd45gip1Q9CR59 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Gadd45gip1Q9CR59 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Gadd45gip1Q9CR59 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Gadd45gip1Q9CR59 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Gadd45gip1Q9CR59 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Gadd45gip1Q9CR59 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Gadd45gip1Q9CR59 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Gadd45gip1Q9CR59 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms