Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR00

Psmd9, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd9Q9CR00 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Psmd9Q9CR00 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Psmd9Q9CR00 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Psmd9Q9CR00 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Psmd9Q9CR00 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Psmd9Q9CR00 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Psmd9Q9CR00 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Psmd9Q9CR00 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Psmd9Q9CR00 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms