Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Atg12Q9CQY1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Atg12Q9CQY1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Atg12Q9CQY1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Atg12Q9CQY1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Atg12Q9CQY1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.8 ms