Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT1

Mri1, Methylthioribose-1-phosphate isomerase, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mri1Q9CQT1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Mri1Q9CQT1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Mri1Q9CQT1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Mri1Q9CQT1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Mri1Q9CQT1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mri1Q9CQT1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mri1Q9CQT1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms