Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok2Q9CQS5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Riok2Q9CQS5 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok2Q9CQS5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok2Q9CQS5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok2Q9CQS5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok2Q9CQS5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Riok2Q9CQS5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Riok2Q9CQS5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Riok2Q9CQS5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Riok2Q9CQS5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Riok2Q9CQS5 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Riok2Q9CQS5 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms