Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nipsnap3bQ9CQE1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nipsnap3bQ9CQE1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nipsnap3bQ9CQE1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Nipsnap3bQ9CQE1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nipsnap3bQ9CQE1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nipsnap3bQ9CQE1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Nipsnap3bQ9CQE1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nipsnap3bQ9CQE1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms