Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC9

Sar1b, GTP-binding protein SAR1b, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sar1bQ9CQC9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sar1bQ9CQC9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sar1bQ9CQC9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Sar1bQ9CQC9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Sar1bQ9CQC9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Sar1bQ9CQC9 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Sar1bQ9CQC9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms