Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Trappc5Q9CQA1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Trappc5Q9CQA1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Trappc5Q9CQA1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Trappc5Q9CQA1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Trappc5Q9CQA1 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trappc5Q9CQA1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.4 ms