Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ07

Lrrc18, Leucine-rich repeat-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc18Q9CQ07 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lrrc18Q9CQ07 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrrc18Q9CQ07 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lrrc18Q9CQ07 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lrrc18Q9CQ07 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Lrrc18Q9CQ07 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrrc18Q9CQ07 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms