Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt88Q9CPR6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Krt88Q9CPR6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Krt88Q9CPR6 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.99
Krt88Q9CPR6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Krt88Q9CPR6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Krt88Q9CPR6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms