Protein–RNA interactions for Protein: Q99M08

Uncharacterized protein C4orf3 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 65 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q99M08 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99M08 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99M08 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q99M08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99M08 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q99M08 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99M08 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99M08 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99M08 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99M08 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99M08 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Q99M08 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99M08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99M08 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Q99M08 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99M08 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99M08 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Q99M08 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Q99M08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99M08 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99M08 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99M08 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99M08 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Q99M08 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99M08 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99M08 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99M08 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99M08 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Q99M08 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99M08 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99M08 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99M08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Q99M08 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99M08 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99M08 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99M08 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99M08 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99M08 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Q99M08 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99M08 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99M08 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Q99M08 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99M08 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Q99M08 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99M08 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99M08 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Q99M08 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
Q99M08 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99M08 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99M08 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99M08 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99M08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Q99M08 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99M08 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99M08 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99M08 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Q99M08 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99M08 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99M08 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Q99M08 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99M08 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99M08 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99M08 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99M08 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Q99M08 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99M08 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Q99M08 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99M08 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99M08 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99M08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99M08 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q99M08 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q99M08 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99M08 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99M08 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99M08 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99M08 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q99M08 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99M08 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99M08 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99M08 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99M08 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99M08 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q99M08 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99M08 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99M08 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q99M08 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q99M08 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99M08 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99M08 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99M08 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q99M08 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Q99M08 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms