Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Rcbtb2Q99LJ7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rcbtb2Q99LJ7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Rcbtb2Q99LJ7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Rcbtb2Q99LJ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcbtb2Q99LJ7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcbtb2Q99LJ7 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
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