Protein–RNA interactions for Protein: Q99KR3

Lactb2, Endoribonuclease LACTB2, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lactb2Q99KR3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lactb2Q99KR3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Lactb2Q99KR3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lactb2Q99KR3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lactb2Q99KR3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Lactb2Q99KR3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Lactb2Q99KR3 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms