Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TrabdQ99JY4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TrabdQ99JY4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TrabdQ99JY4 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
TrabdQ99JY4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TrabdQ99JY4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TrabdQ99JY4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TrabdQ99JY4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TrabdQ99JY4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TrabdQ99JY4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms