Protein–RNA interactions for Protein: Q99JT1

Gatb, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GatbQ99JT1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
GatbQ99JT1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
GatbQ99JT1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GatbQ99JT1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
GatbQ99JT1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GatbQ99JT1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
GatbQ99JT1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GatbQ99JT1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
GatbQ99JT1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GatbQ99JT1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
GatbQ99JT1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 265.2 ms