Protein–RNA interactions for Protein: Q99J95

Cdk9, Cyclin-dependent kinase 9, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk9Q99J95 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cdk9Q99J95 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cdk9Q99J95 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cdk9Q99J95 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Cdk9Q99J95 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cdk9Q99J95 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cdk9Q99J95 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms