Protein–RNA interactions for Protein: Q99J87

Dhx58, Probable ATP-dependent RNA helicase DHX58, mousemouse

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx58Q99J87 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx58Q99J87 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Dhx58Q99J87 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Dhx58Q99J87 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Dhx58Q99J87 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Dhx58Q99J87 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Dhx58Q99J87 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Dhx58Q99J87 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Dhx58Q99J87 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Dhx58Q99J87 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms