Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cldn16Q925N4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cldn16Q925N4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Cldn16Q925N4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cldn16Q925N4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cldn16Q925N4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
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