Protein–RNA interactions for Protein: Q91XL2

Lnx2, Ligand of Numb protein X 2, mousemouse

Predictions only

Length 687 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx2Q91XL2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lnx2Q91XL2 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Lnx2Q91XL2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Lnx2Q91XL2 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lnx2Q91XL2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lnx2Q91XL2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Lnx2Q91XL2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lnx2Q91XL2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms