Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD6

Vps36, Vacuolar protein-sorting-associated protein 36, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps36Q91XD6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Vps36Q91XD6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Vps36Q91XD6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Vps36Q91XD6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Vps36Q91XD6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Vps36Q91XD6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Vps36Q91XD6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Vps36Q91XD6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms