Protein–RNA interactions for Protein: Q91W67

Ubl7, Ubiquitin-like protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl7Q91W67 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ubl7Q91W67 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ubl7Q91W67 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ubl7Q91W67 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ubl7Q91W67 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubl7Q91W67 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubl7Q91W67 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms