Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIG1

Rest, RE1-silencing transcription factor, mousemouse

Predictions only

Length 1,082 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RestQ8VIG1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,07■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC29,07■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,07■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,05■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,04■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,04■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,02■■■□□ 2,24
RestQ8VIG1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,01■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28,98■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28,96■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28,96■■■□□ 2,23
RestQ8VIG1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28,95■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC28,95■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28,94■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28,94■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28,94■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC28,93■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28,92■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,91■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28,91■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28,89■■■□□ 2,22
RestQ8VIG1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,89■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28,88■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC28,88■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,88■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28,87■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,86■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28,86■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28,86■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28,85■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28,85■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,85■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,84■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC28,83■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,83■■■□□ 2,21
RestQ8VIG1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28,82■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC28,82■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,82■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,81■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28,8■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28,8■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28,79■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28,79■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,79■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28,78■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,77■■■□□ 2,2
RestQ8VIG1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,76■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28,76■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC28,75■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28,75■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,75■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,74■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28,73■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28,73■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28,72■■■□□ 2,19
RestQ8VIG1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,7 ms