Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE62

Paip1, Polyadenylate-binding protein-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paip1Q8VE62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Paip1Q8VE62 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Paip1Q8VE62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Paip1Q8VE62 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Paip1Q8VE62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Paip1Q8VE62 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Paip1Q8VE62 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paip1Q8VE62 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Paip1Q8VE62 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms