Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sgip1Q8VD37 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sgip1Q8VD37 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Sgip1Q8VD37 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Sgip1Q8VD37 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC29.97■■■□□ 2.39
Sgip1Q8VD37 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Sgip1Q8VD37 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.9■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Sgip1Q8VD37 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Sgip1Q8VD37 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.79■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Sgip1Q8VD37 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.75■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Sgip1Q8VD37 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Sgip1Q8VD37 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Sgip1Q8VD37 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
Sgip1Q8VD37 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Sgip1Q8VD37 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.8 ms