Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBX6

Mpdz, Multiple PDZ domain protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MpdzQ8VBX6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22,49■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22,48■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,48■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,46■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,46■■□□□ 1,19
MpdzQ8VBX6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22,45■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22,44■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22,43■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22,42■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22,42■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,42■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22,4■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22,4■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
MpdzQ8VBX6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,39■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,38■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22,37■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22,34■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22,33■■□□□ 1,17
MpdzQ8VBX6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,33■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22,32■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22,32■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22,29■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,28■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,28■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22,27■■□□□ 1,16
MpdzQ8VBX6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22,26■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22,26■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22,26■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,26■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22,25■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22,24■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,23■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,22■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
MpdzQ8VBX6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,2■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22,18■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22,18■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22,17■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22,17■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22,15■■□□□ 1,14
MpdzQ8VBX6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,14■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,14■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,13■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22,12■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22,11■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,1■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
MpdzQ8VBX6 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms