Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4K2

Irak4, Interleukin-1 receptor-associated kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irak4Q8R4K2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Irak4Q8R4K2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Irak4Q8R4K2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Irak4Q8R4K2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Irak4Q8R4K2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Irak4Q8R4K2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Irak4Q8R4K2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms