Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4F0

Mcoln3, Mucolipin-3, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln3Q8R4F0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Mcoln3Q8R4F0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mcoln3Q8R4F0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mcoln3Q8R4F0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Mcoln3Q8R4F0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mcoln3Q8R4F0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mcoln3Q8R4F0 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mcoln3Q8R4F0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms