Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4D1

Slc9a8, Sodium/hydrogen exchanger 8, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a8Q8R4D1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc9a8Q8R4D1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9a8Q8R4D1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc9a8Q8R4D1 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc9a8Q8R4D1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc9a8Q8R4D1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc9a8Q8R4D1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms