Protein–RNA interactions for Protein: Q8R373

Clmp, CXADR-like membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClmpQ8R373 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ClmpQ8R373 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ClmpQ8R373 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ClmpQ8R373 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ClmpQ8R373 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ClmpQ8R373 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ClmpQ8R373 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms